এটি লিনাক্স অনলাইনে চালানোর জন্য স্মিথওয়াটারম্যান নামে একটি লিনাক্স অ্যাপ যার সর্বশেষ রিলিজটি smith_waterman-0.2.3.tar.gz হিসাবে ডাউনলোড করা যেতে পারে। এটি ওয়ার্কস্টেশনের জন্য বিনামূল্যের হোস্টিং প্রদানকারী OnWorks-এ অনলাইনে চালানো যেতে পারে।
ডাউনলোড করুন এবং অনলাইনে চালান SmithWaterman নামের এই অ্যাপটি বিনামূল্যে OnWorks-এর সাথে Linux-এ চালানোর জন্য।
এই অ্যাপটি চালানোর জন্য এই নির্দেশাবলী অনুসরণ করুন:
- 1. আপনার পিসিতে এই অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন৷
- 2. আমাদের ফাইল ম্যানেজারে প্রবেশ করুন https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনি যে ইউজারনেম চান।
- 3. এই ধরনের ফাইল ম্যানেজারে এই অ্যাপ্লিকেশনটি আপলোড করুন।
- 4. এই ওয়েবসাইট থেকে OnWorks Linux অনলাইন বা Windows অনলাইন এমুলেটর বা MACOS অনলাইন এমুলেটর শুরু করুন।
- 5. OnWorks Linux OS থেকে আপনি এইমাত্র শুরু করেছেন, আমাদের ফাইল ম্যানেজারে যান https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX আপনার পছন্দের ব্যবহারকারীর নাম সহ।
- 6. অ্যাপ্লিকেশনটি ডাউনলোড করুন, এটি ইনস্টল করুন এবং এটি চালান।
স্ক্রীনশটগুলি
Ad
স্মিথওয়াটারম্যান লিনাক্সে অনলাইনে চালানোর জন্য
বর্ণনাঃ
GITHB-এ সরানো হয়েছে: https://github.com/noporpoise/seq-alignস্মিথ-ওয়াটারম্যান স্থানীয় সিকোয়েন্স অ্যালাইনমেন্ট অ্যালগরিদমের বাস্তবায়ন।
Needleman-Wunsch ব্যবহার করে আমাদের বোন প্রজেক্ট গ্লোবাল অ্যালাইনমেন্ট দেখুন:
http://sourceforge.net/projects/needlemanwunsch/
বৈশিষ্ট্য
- Affine ফাঁক জরিমানা
- রঙিন আউটপুট
- FASTA, FASTQ এবং প্লেইন সিকোয়েন্স ফাইল পড়ে (inc. gzip'ed ফাইল)
- প্রিসেট ডিএনএ/প্রোটিন প্রতিস্থাপন ম্যাট্রিক্স (PAM/BLOSUM ইত্যাদি)
- পেনাল্টি প্রতিস্থাপন ম্যাট্রিক্স লোড করতে পারেন
- পোর্টেবল সি কোড যা অন্যান্য বায়োইনফরমেটিক্স প্রকল্পে ব্যবহার করা যেতে পারে
পাঠকবর্গ
বিজ্ঞান/গবেষণা, শিক্ষা
ব্যবহারকারী ইন্টারফেস
কনসোল/টার্মিনাল, কমান্ড-লাইন
প্রোগ্রামিং ভাষা
সি++, সি
এটি একটি অ্যাপ্লিকেশন যা https://sourceforge.net/projects/smithwaterman/ থেকেও আনা যেতে পারে। আমাদের বিনামূল্যের অপারেটিভ সিস্টেমগুলির মধ্যে একটি থেকে সবচেয়ে সহজ উপায়ে অনলাইনে চালানোর জন্য এটি OnWorks-এ হোস্ট করা হয়েছে।