Dies ist der Befehl asn2ff, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider über eine unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
asn2ff - Konvertieren von biologischen ASN.1-Daten in ein flaches Format (alte Version)
ZUSAMMENFASSUNG
asn2ff [-] [-A X] [-B X] [-C] [-G] [-L F] [-M] [-R] [-V F] [-a Dateinamen] [-b] [-d] [-e]
[-f b/p/e/s/x/z] [-g] [-h F] [-k F] [-l Dateinamen] [-m r/d/s/c/k/l/e/p] [-n F]
[-o Dateinamen] [-p F] [-q] [-r Dateinamen] [-s] [-t] [-v F] [-w] [-y] [-z]
BESCHREIBUNG
asn2ff wandelt Beschreibungen biologischer Sequenzen aus dem ASN.1-Format von NCBI in eines von
mehrere Flatfile-Formate. Dieses Programm basiert auf einer veralteten Schnittstelle. bitte
- asn2gb(1) stattdessen.
OPTIONAL
Nachfolgend finden Sie eine Zusammenfassung der Optionen.
- Nutzungsnachricht drucken
-A X Region anzeigen ab X (Standard ist 0)
-B X Region anzeigen, die auf endet X (Standard ist die letzte Position)
-C Bankit-Kommentare anzeigen
-G Der Output ist nur in der Genomansicht eine Top-Bioseq
-L F Altes LOCUS-Linienformat (vor Genbank 127.0) verwenden
-M Ausgabe ist nur Kartenbioseqs
-R Für GenBank-Release
-V F VERSION nicht verwenden
-a Dateinamen
Dateiname für ASN.1-Eingabe (Standard ist stdin)
-b asnfile im Binärmodus eingeben
-d SeqMgr-Indizierung verwenden
-e Eingabe ist ein Seq-Eintrag
-f b/p/e/s/x/z
Ausgabeformat:
b GenBank (Standard)
p GenPept
und EMBL
s PseudoEMBL
x GenBankSelect
z EMBLPEPT
-g Gi-Nummern anzeigen
-h F Sequenz ausblenden
-k F Verwenden Sie keine komplexen Sets (Phy-Set, Mut-Set, Pop-Set)
-l Dateinamen
Fehler protokollieren an Dateinamen
-m r/d/s/c/k/l/e/p
Ausgabemodus:
r freigeben (Standard)
d Dump
s Pailletten
c Chromoskop
k dir-sub-debug
l dir-sub
ich überarbeite
p Teilbericht
-n F Strenge Genbindung
-o Dateinamen
Ausgabedateiname (Standard ist stdout)
-p F Neue Genmerkmale weglassen
-q Ausgabe ist nur ein Top-Bioseq
-r Dateinamen
Fehlerprotokolldatei ausgeben (Standard ist stderr)
-s Eingabe ist ein Seq-Submit
-t Ausführlichen Nachrichtentext anzeigen
-v F Fehlermeldungen unterdrücken
-w Verwenden Sie das HTML-Ausgabeformat
-y Nur Hilfeformat drucken
-z Neuer Algorithmus für Orgnamen
Verwenden Sie asn2ff online mit den onworks.net-Diensten
