bp_chaos_plotp – Online in der Cloud

PROGRAMM:

NAME/FUNKTION

bp_chaos_plot – ein Chaosplot aus DNA- und RNA-Sequenzen

ZUSAMMENFASSUNG

bp_chaos_plot.pl -i/--input=INPUTFILE -f/--format=SEQFORMAT
-o/--output=AUSGABEDATEI -g/--graphics=GRAFIKFORMAT
-w/--width=BREITE -h/--height=HÖHE

BESCHREIBUNG

Dieses Skript generiert Bilddateien mithilfe der GD-Bildbibliothek zur Visualisierung von Nukleotiden
Sequenzen mit Chaosplot.

OPTIONAL

Gültige Grafikformate sind derzeit gd, gd2, png, wbmp, jpeg und gif.

Die Standardgröße der Bilddatei beträgt 600 x 400.

Die Sequenzeingabe kann mit einer der drei Methoden bereitgestellt werden:

unbenanntes Argument
bp_chaos_plot-Dateiname

benanntes Argument
bp_chaos_plot -i Dateiname

Standardeingabe
bp_chaos_plot < Dateiname

FEEDBACK

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AUTOR - Horst Stajich

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GESCHICHTE

Dieser Code basiert auf dem EMBOSS C-Code für chaos.c von Ian Longden. Enthalten sind
Dokumentation aus EMBOSS-Code:

Chaos erzeugt eine Chaos-Handlung. Die ursprüngliche Anwendung ist Teil des ACEDB-Genoms
Datenbankpaket, geschrieben von ** Richard Durbin (MRC LMB, UK) [E-Mail geschützt] und
Jean Thierry-Mieg (CRBM du CNRS, Frankreich) [E-Mail geschützt]

Verwenden Sie bp_chaos_plotp online über die Dienste von onworks.net