Dies ist der Befehl bp_seqcutp, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
bp_seqcut.pl
ANWENDUNG
bp_seqcut.pl [Optionen -h,-s,-e,-f,-w] ...
bp_seqcut.pl [Optionen -h,-f,-w] se ...
-h diese Hilfemeldung
-s, an welchem Rückstand mit dem Schneiden begonnen werden soll
-e, welche Rückstände noch weitergeschnitten werden sollen
-f-Format der Dateien, standardmäßig FASTA, Sie können jedoch alles angeben, was von SeqIO von BioPerl unterstützt wird
-w Hard-Wrap-Breite, dies wird je nach verwendetem Format möglicherweise nicht unterstützt
Beschreibung
Ein Skript zum Schneiden von FASTA-Sequenzen mit einem bestimmten Bereich „fastacut -s 1 -e 10 *.fasta“ oder
`fastacut 1-10 *.fasta`. Dies ist nur ein praktischer Wrapper um das Bio::SeqIO-Modul.
Nützlich, wenn Sie einen Abschnitt einer Achse ausschneiden möchten, um ein Profil eines bestimmten Objekts zu erstellen
Bereich der Sequenz.
Verwenden Sie bp_seqcutp online über die Dienste von onworks.net
