Dies ist der Befehl br_biofetch, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
br_biofetch.rb – Biofetch-Client
ZUSAMMENFASSUNG
br_biofetch.rb [-s Server] [db] [id] [Stil] [Format]
BESCHREIBUNG
Diese Handbuchseite dokumentiert kurz die br_biofetch.rb.
br_biofetch.rb ist ein sehr einfacher Biofetch-Client. Sie können eine Verbindung zu einem Biofetch-Server herstellen und
Datenbankeinträge einschließlich Sequenzinformationen abrufen.
OPTIONAL
-s Geben Sie die URL des BioFetch-CGI an (Standard ist http://bioruby.org/cgi-
bin/biofetch.rb)
-e Nutzen Sie den EBI-Server unter http://www.ebi.ac.uk/cgi-bin/dbfetch
-r Verwenden Sie den BioRuby-Server unter http://bioruby.org/cgi-bin/biofetch.rb
db Name der Datenbank. Dazu gehören Optionen wie refseq, genbank, embl, swissprot usw.
Diese Option hängt davon ab, welchen Biofetch-Server Sie verwenden.
id Eintrags-ID
Stil „raw“ oder „html“ (Standard ist „raw“)
Format Ausgabeformat („Standard“, „Fasta“, „etc“)
Nutzen Sie br_biofetch online über die Dienste von onworks.net
