Dies ist der Befehl cassiopee, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
Cassiopee – Handbuchseite für Cassiopee Version 1.0
ZUSAMMENFASSUNG
Cassiopee [Optionen]
BESCHREIBUNG
Verwendung:
-l: maximale Indextiefe / maximale Mustergröße
-u: Index zur späteren Verwendung speichern
-s: Sequenz zum Indexieren
-p: Muster zum Suchen
-f: Datei, die das zu durchsuchende Muster enthält
-o: Ausgabedatei
-r: Baumreduzierung anwenden
-m: Suchmodus: 0=DNA, 1=RNA, 2=Protein
-a: Alphabet-Mehrdeutigkeitssuche zulassen
-n: Maximal aufeinanderfolgende N zulässige Übereinstimmungen in der Suche
-e: Maximal zulässige Ersetzungsübereinstimmungen in der Suche
-i: maximal zulässige Übereinstimmungen in der Suche
-g: Erzeugt eine Punktdatei des Diagramms
-d: maximale Tiefe des Diagramms
-t: Ausgabeformat: 0:tsv (Standard), 1:json
-x: Mindestposition in der Reihenfolge
-y: maximale Position in der Reihenfolge
-v: Version anzeigen
-h: Diese Nachricht anzeigen
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