cmtk-reformatx – Online in der Cloud

PROGRAMM:

NAME/FUNKTION

reformatx – Volume-Reformatierer

ZUSAMMENFASSUNG

reformatx [Optionen] --floating floatImg Ziel x0 [x1 ...]
ODER reformatx [Optionen] Ziel [x0 x1 ...] {-j,--jacobian} xx0 [xx1 ...]
ODER WO x0 ... xN und xx0 ... xxN ist [{-i,--inverse}] Transformation##. (Wenn der erste
Wenn die Transformation in der Sequenz invertiert ist, muss „--inverse“ mit „--“ vorangestellt werden.
d. h. verwenden Sie „-- --inverse xform.path“).

BESCHREIBUNG

Erweitertes Volume-Reformatierungstool zur Berechnung neu formatierter Bilder und Jacobi-Karten
beliebige Folgen verketteter Transformationen

OPTIONAL

Global Toolkit Optionen (diese sind von Locals geführtes by alle CMTK Werkzeuge)
--help
Schreiben Sie eine Liste der grundlegenden Befehlszeilenoptionen in die Standardausgabe.

--Hilf allen
Schreiben Sie eine vollständige Liste der grundlegenden und erweiterten Befehlszeilenoptionen in die Standardausgabe.

- Wiki
Schreiben Sie eine Liste der Befehlszeilenoptionen in die Standardausgabe im MediaWiki-Markup.

--Mann
Schreiben Sie die Manpage-Quelle im 'nroff'-Markup in die Standardausgabe.

--Version
Schreiben Sie die Toolkit-Version in die Standardausgabe.

--Echo
Schreiben Sie die aktuelle Befehlszeile in die Standardausgabe.

--verbose-level
Ausführlichkeitsstufe festlegen.

- ausführlich, -v
Erhöhen Sie die Ausführlichkeitsstufe um 1 (veraltet; aus Gründen der Abwärtskompatibilität unterstützt).

--fäden
Legen Sie die maximale Anzahl paralleler Threads fest (für POSIX-Threads und OpenMP).

--Ausgabetyp
Skalarer Datentyp für das Ausgabebild. Unterstützte Werte: „char“, „byte“, „short“,
„ushort“, „int“, „uint“, „float“, „double“ oder verwenden Sie eines der folgenden:

--verkohlen
8 Bit, signiert

--Byte
8 Bit, ohne Vorzeichen

--kurz
16 Bit, signiert

--ukurz
16 Bit, ohne Vorzeichen

--int
32 Bit signiert

--uint
32 Bit ohne Vorzeichen

--schweben
32-Bit-Gleitkomma

--doppelt
64-Bit-Gleitkomma

--pad-out , -P
Füllwert für das Ausgabebild [Standard: 0]

Optionen für Ebene Neuformatierung
--Interpolation
Bildinterpolationsmethode. Unterstützte Werte: „linear“, „nn“, „cubic“, „pv“, „sinc-
cosine“, „sinc-hamming“, wobei der Standardwert „linear“ ist, oder verwenden Sie eine der folgenden Optionen:

--linear
Trilineare Interpolation [Dies is Ursprünglich]

--nn Nächster Nachbar-Interpolation

--kubisch
Trikubische Interpolation

--pv Teilvolumeninterpolation

--sinc-cosinus
Sinc-Interpolation mit Kosinusfenster

--sinc-hamming
Sinc-Interpolation mit Hamming-Fenster

--sinc-window-radius
Fensterradius für Sinc-Interpolation [Standard: 3]

--preserve-mass
Massenerhaltende Neuformatierung: Multiplizieren Sie jeden neu formatierten Wert mit dem Jacobi
Determinante der angewandten Transformation.

Optionen für Jakobiner Karte Neuformatierung
--jacobian-correct-global
Korrekte Jacobi-Karten für den globalen Maßstab.

--no-jacobian-correct-global
Korrigieren Sie Jacobi-Karten nicht für den globalen Maßstab. [Dies is Ursprünglich]

zufuhr Optionen
--target-grid
Definieren Sie das Zielgitter für die Neuformatierung als Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz]
(dimmt:pixel:offset)

--Maske, -m
Verwenden Sie Zielpixeldaten als Binärmaske.

--Ernte
Zielbild zuschneiden: x0,y0,z0,x1,y1,z2

--target-offset , -O
Überschreiben Sie den Zielbildversatz und stellen Sie ihn auf x,y,z mm ein

--target-offset-pixels
Zielbild-Offset überschreiben und auf dx,dy,dz Pixel einstellen

--schwebend , -F
Format und Pfad des schwebenden Bildes. [Standard: KEINER]

--pad-floating
Füllwert für das schwebende Bild [Standard: Behinderte]

Output Optionen
--outfile , -o
Format und Pfad des Ausgabebildes. [Standard: reformat.nii ]

Bild/Transformation Datenbase
--db
Pfad zur Bild-/Transformationsdatenbank, die mit dem neu erstellten aktualisiert werden soll
Bild. [Standard: KEINER]

AUTOREN

Torsten Rohlfing, mit Beiträgen von Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakow und Yaroslav Halchenko

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