Dies ist der Befehl cmtk-unwarp_image_phantom, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Anbieter über eine unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
unwarp_image_phantom - Erstellen Sie eine Transformation, um ein Bild basierend auf einem Phantom zu entzerren
Beschreibung
ZUSAMMENFASSUNG
unwarp_image_phantom InputPhantom InputImage OutputXform
BESCHREIBUNG
Dieses Werkzeug berechnet entweder eine Polynomtransformation oder eine B-Spline-Freiformverformung zu
ein Bild entzerren. Die Transformation basiert auf erwarteten und erkannten Landmarken in einem
Bild eines Strukturphantoms, das mit demselben Scanner aufgenommen wurde. Verwenden Sie das 'detect_adni_phantom'
Werkzeug zum Erkennen von Orientierungspunkten des ADNI-Phantoms in einem Bild und zur Generierung eines Phantoms
Beschreibungsdatei, die für die Verwendung mit diesem Tool geeignet ist.
OPTIONAL
Global Toolkit Optionen (diese sind von Locals geführtes by alle CMTK Werkzeuge)
--help
Schreiben Sie eine Liste der grundlegenden Befehlszeilenoptionen in die Standardausgabe.
--Hilf allen
Schreiben Sie eine vollständige Liste der grundlegenden und erweiterten Befehlszeilenoptionen in die Standardausgabe.
- Wiki
Schreiben Sie eine Liste der Befehlszeilenoptionen in die Standardausgabe im MediaWiki-Markup.
--Mann
Schreiben Sie die Manpage-Quelle im 'nroff'-Markup in die Standardausgabe.
--Version
Schreiben Sie die Toolkit-Version in die Standardausgabe.
--Echo
Schreiben Sie die aktuelle Befehlszeile in die Standardausgabe.
--verbose-level
Ausführlichkeitsstufe festlegen.
- ausführlich, -v
Erhöhen Sie die Ausführlichkeitsstufe um 1 (veraltet; aus Gründen der Abwärtskompatibilität unterstützt).
--fäden
Legen Sie die maximale Anzahl paralleler Threads fest (für POSIX-Threads und OpenMP).
Passend zu Optionen
--fit-inverse
Inverse Transformation anpassen (die tatsächlichen zu den erwarteten Orientierungspunkten abbilden). Das ist
nützlich für die Berechnung einer Jacobi-Volumenkorrekturkarte (mit 'reformatx') ohne
die angepasste Entzerrungstransformation numerisch invertieren müssen.
--fit-vorwärts
Vorwärtstransformation anpassen (Zuordnung auf tatsächliche Sehenswürdigkeiten erwartet). Das ist
nützlich zum Korrigieren des Bildes durch Reslicing (mit 'reformatx'). [Dies is
Ursprünglich]
Transformation Modelle
-Spline
Passen Sie B-Spline-Freiformverformung an.
--poly
Fit-Polynom-Transformation. [Dies is Ursprünglich]
Polynom Passend zu Optionen (mit --poly)
--Grad
Grad der angepassten Polynomtransformation. [Standard: 4]
B-Splines Passend zu Optionen (mit --Spline)
--final-cp-abstand
Endgültiger Kontrollpunktrasterabstand der Ausgabe-B-Spline-Transformation. [Standard: 0]
--final-cp-dims
Endgültige Passpunktrasterabmessungen (dh Anzahl der Passpunkte) der Ausgabe B-
Spline-Transformation. Als 'dimX,dimY,dimZ' bereitzustellen. [Standard: KEINER]
--Ebenen
Anzahl der Ebenen im mehrstufigen B-Spline-Approximationsverfahren. [Standard: 1]
--iterationen-per-level
Maximale Anzahl von Spline-Koeffizienten-Update-Iterationen pro Ebene im Multi-Level
B-Spline-Approximationsverfahren. [Standard: 100]
--rms-threshold
Schwellenwert für die relative Verbesserung des RMS-Anpassungsrests. Die passende Iteration
beendet, wenn (rmsAfterUpdate-rmsBeforeUpdate)/rmsBeforeUpdate < Schwellenwert.
[Standard: 0]
--no-fit-affin
Deaktivieren Sie die Anpassung der affinen Transformation, um den Spline zu initialisieren. Passen Sie stattdessen den Spline an
direkt. Dies führt normalerweise zu schlechteren Ergebnissen und wird davon abgeraten.
AUTOREN
Torsten Rohlfing, mit Beiträgen von Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakow und Yaroslav Halchenko
Verwenden Sie cmtk-unwarp_image_phantom online mit den onworks.net-Diensten
