Dies ist der Befehl dbifastae, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider über eine unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
dbifasta - Index einer Fasta-Dateidatenbank
ZUSAMMENFASSUNG
dbifasta -Datenbankname Schnur -idformat Liste -Verzeichnis Verzeichnis -Dateinamen Schnur
-freigeben Schnur -Datum Schnur -Felder Liste -ausschließen Schnur -maxindex ganze Zahl
-Sortieroptionen Schnur -Systemsortierung boolean -Aufräumen boolean -outfile Outfile
-indexoutdir draußen
dbifasta -Hilfe
BESCHREIBUNG
dbifasta ist ein Kommandozeilenprogramm von EMBOSS („the European Molecular Biology Open
Software-Suite“). Es ist Teil der Befehlsgruppe(n) "Utils:Datenbankindizierung".
OPTIONAL
zufuhr Abschnitt
-Datenbankname Schnur
-idformat Liste
Standardwert: idacc
-Verzeichnis Verzeichnis
Standardwert: .
-Dateinamen Schnur
Standardwert: *.dat
Erforderlich Abschnitt
-freigeben Schnur
Standardwert: 0.0
-Datum Schnur
Standardwert: 00/00/00
Fortgeschrittener Abschnitt
-Felder Liste
Standardwert: acc
-ausschließen Schnur
-maxindex ganze Zahl
-Sortieroptionen Schnur
Sortieroptionen, normalerweise '-T .' um das aktuelle Verzeichnis für Arbeitsdateien zu verwenden und '-k 1,1' um
GNU-Sortierung erzwingen, um das erste Feld zu verwenden Standardwert: -T . -k 1,1
-Systemsortierung boolean
Standardwert: Y
-Aufräumen boolean
Standardwert: Y
Output Abschnitt
-outfile Outfile
-indexoutdir draußen
Standardwert: .
Verwenden Sie dbifastae online mit den onworks.net-Diensten
