Dies ist der Befehl fastaq-trim_contigs, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
fastaq_trim_contigs – Schneidet eine festgelegte Anzahl von Basen am Ende jedes Contigs ab
BESCHREIBUNG
Verwendung: fastaq_trim_contigs [Optionen]
Schneidet eine festgelegte Anzahl von Basen am Ende jedes Contigs ab, sodass Lücken größer und contig werden
Enden werden entfernt. Basen werden durch Ns ersetzt. Jede Sequenz, die am Ende alle Ns enthält, geht verloren
positionell Argumente:
infile Name der Eingabedatei
Outfile
Name der Ausgabedatei
optional Argumente:
-h, --help
Diese Hilfemeldung anzeigen und beenden
--trim_number TRIM_NUMBER
Anzahl der Basen, die um jede Lücke und die Enden jeder Sequenz gekürzt werden müssen [100]
Nutzen Sie fastaq-trim_contigs online über die Dienste von onworks.net
