Dies ist der Befehl fdnadiste, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
fdnadist – Nukleinsäuresequenz-Distanzmatrixprogramm
ZUSAMMENFASSUNG
fdnadist -Reihenfolge seqsetall -Methode Liste -Gamma Liste -ncategories ganze Zahl -Bewertung Array
-Kategorien immobilien [-Gewichte immobilien] -Gammakoeffizient schweben
-invarfrac schweben -ttratio schweben -freqsfrom Umschalten -Basisfrequenz Array
[-niedriger boolean] [-für Menschen lesbar boolean] -outfile Outfile [-Druckdaten boolean]
[-Fortschritt boolean]
fdnadist -Hilfe
BESCHREIBUNG
fdnadist ist ein Kommandozeilenprogramm von EMBOSS („the European Molecular Biology Open
Software-Suite“). Es ist Teil der Befehlsgruppe(n) "Phylogenie:Molekulare Sequenz".
OPTIONAL
zufuhr Abschnitt
-Reihenfolge seqsetall
Datei mit einem oder mehreren Sequenz-Alignments
-Methode Liste
Standardwert: F84 Distanzmodell
-Gamma Liste
Standardwert: Keine Verteilungsparameter verwendet
-ncategories ganze Zahl
Standardwert: 1
-Bewertung Array
Standardwert: 1.0
-Kategorien immobilien
Datei der Substitutionsratenkategorien
-Gewichte immobilien
Zusätzliche Abschnitt
-Gammakoeffizient schweben
Standardwert: 1
-invarfrac schweben
Standardwert: 0.0
-ttratio schweben
Standardwert: 2.0
-freqsfrom Umschalten
Standardwert: Y
-Basisfrequenz Array
Standardwert: 0.25 0.25 0.25 0.25
-niedriger boolean
Standardwert: N
-für Menschen lesbar boolean
Standardwert: @($(method)==s?Y:N)
Output Abschnitt
-outfile Outfile
-Druckdaten boolean
Standardwert: N
-Fortschritt boolean
Standardwert: Y
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