Dies ist der Befehl gt-stat, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
gt-stat – Statistiken zu in GFF3-Dateien enthaltenen Funktionen anzeigen.
ZUSAMMENFASSUNG
gt Zustand [Option ...] [GFF3_Datei ...]
BESCHREIBUNG
-genelengthdistri [ja|nein]
Genlängenverteilung anzeigen (Standard: nein)
-genescoredistri [ja|nein]
Gen-Score-Verteilung anzeigen (Standard: Nein)
-exonlengthdistri [ja|nein]
Exon-Längenverteilung anzeigen (Standard: Nein)
-exonnumberdistri [ja|nein]
Exon-Nummernverteilung anzeigen (Standard: Nein)
-intronlengthdistri [ja|nein]
Intronlängenverteilung anzeigen (Standard: Nein)
-cdslengthdistri [ja|nein]
CDS-Längenverteilung anzeigen (gemessen in Aminosäuren) (Standard: nein)
-source [ja|nein]
Zeigt den Satz der verwendeten Quell-Tags an (Spalte 2 in regulären GFF3-Zeilen) (Standard: Nein)
-Addintrons [ja|nein]
Fügen Sie Intron-Merkmale zwischen vorhandenen Exon-Merkmalen hinzu (bevor Sie Statistiken berechnen) (Standard:
Nein)
-v [ja|nein]
ausführlich sein (Standard: nein)
-o [Dateinamen]
Ausgabe an angegebene Datei umleiten (Standard: undefiniert)
-gzip [ja|nein]
gzip komprimierte Ausgabedatei schreiben (Standard: nein)
-bzip2 [ja|nein]
bzip2-komprimierte Ausgabedatei schreiben (Standard: nein)
-Macht [ja|nein]
Schreiben in Ausgabedatei erzwingen (Standard: nein)
-Hilfe
Hilfe anzeigen und beenden
-Ausführung
Versionsinformationen anzeigen und beenden
REPORTING Fehler
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