Dies ist der Befehl maq.pl, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider über eine unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
maq.pl - Hilfsskript für maq
ZUSAMMENFASSUNG
maq.pl [Optionen] [...]
BESCHREIBUNG
Hilfsskript für maq
Version: 0.4.7
OPTIONEN.
Leichtlauf
einfache Pipeline für kleine Datensätze
Demo Demonstration der maq-Funktionalitäten (nur für SE)
SNP-Filter
SNPs filtern
Statistik
Extrahieren Sie Statistiken aus der Fehlerausgabe von 'maq map'
chrpt2snp
Konvertieren Sie die chr_rpt-Datei von dbSNP in eine .snp-Datei
ucsc2snp
Konvertieren Sie den SNP-Dump von UCSC in eine .snp-Datei
fastq2bfq
Fastq im Batch konvertieren
cat2pair
Konvertieren des gepaarten Endleseformats
sv nennen strukturelle Variationen
unabhängig
Nachbearbeitung der indelpe-Ausgabe
Verwenden Sie maq.pl online mit den onworks.net-Diensten