Dies ist der Befehl marscane, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
marscan – Findet MRS-Signaturen (Matrix/Scaffold Recognition) in DNA-Sequenzen
ZUSAMMENFASSUNG
marscan -Reihenfolge Fortsetzung -outfile berichten
marscan -Hilfe
BESCHREIBUNG
marscan ist ein Kommandozeilenprogramm von EMBOSS („the European Molecular Biology Open
Software-Suite“). Es ist Teil der Abteilung „Nucleic:Gene finding,Nucleic:Functional“.
„sites,Nucleic:Transcription“-Befehlsgruppe(n).
OPTIONAL
zufuhr Abschnitt
-Reihenfolge Fortsetzung
Output Abschnitt
-outfile berichten
Datei zur Ausgabe von MAR/SAR-Recognition-Signatur-Regionen (MRS). Darin sind Einzelheiten enthalten
des MRS im normalen GFF-Format. Das MRS besteht aus zwei Erkennungsstellen, einer von acht
bp und eines von 16 bp auf jedem Sense-Strang der genomischen DNA, innerhalb von jeweils 200 bp
anderen.
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