Dies ist der Befehl mbfa-mpi, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
mbfa - Murasaki Binary FASTA Formatkonverter
ZUSAMMENFASSUNG
mbfa [Optionen...] [Eingabe] [Eingabe2 ...] #convert [Eingabe] und [Eingabe2 ...] in Muraaski Binary FASTA-Dateien
BESCHREIBUNG
Murasaki verarbeitet Sequenzdaten mit einem 2-Bit-Format, in dem jede Base mit . dargestellt wird
2 Bit. Es gibt eine Reihe von bereits existierenden Formaten, die ähnliche Dinge tun, jedoch in
Murasaki muss insbesondere über die Metadaten Bescheid wissen, die nicht in nur 2 . ausgedrückt werden können
Bits (z. B. wo Sequenzen von NNNNs sind, Sequenzunterbrechungen, wenn mehrere Sequenzen sind
in einer FASTA-Datei enthalten usw.), daher enthält das MBFA-Format auch diese Daten.
Normalerweise werden diese Dateien automatisch von Murasaki generiert, wenn sie zum ersten Mal auf einem neuen laufen
Sequenz.
Da das Dateiformat eng mit Murasaki verzahnt ist, ist die eigentliche Dateierweiterung
wird variieren, um Ihre Architektur widerzuspiegeln. Es wird im Allgemeinen eine Form von .mbfa sein[48][48]
(zB ".mbfa88" (der Standard-Gcc-Build auf einem amd64)).
OPTIONAL
--info|-ich
Metadaten zu jedem angegebenen MBFA anzeigen.
--force|-f
Standardmäßig mbfa überspringt Dateien, die bereits aktuelle .mbfa-Dateien enthalten. Diese Option
erzwingt die Neugenerierung dieser Dateien.
--tödlich|-F
Macht Fehler fatal. Wenn Sie mehrere Dateien angeben, wird mbfa normalerweise versuchen zu konvertieren
alle von ihnen, auch wenn man keine Warnung ausgibt. Mit --fatal wird es angehalten und beendet
mit einem Fehler, wenn ein Problem auftritt.
--fasta|-A
Generiert eine FASTA-Ausgabe entsprechend den MBFA-Daten zu stdout.
--help|-h, --version|-V, --verbose|-V
Was Sie erwarten würden.
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