Dies ist der Befehl mia-2dmyocard-icaseries, der beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
mia-2dmyocard-icaseries – Führen Sie eine ICA-Analyse für eine Reihe von 2D-Bildern durch
ZUSAMMENFASSUNG
mia-2dmyocard-icaseries -i [Optionen]
BESCHREIBUNG
mia-2dmyocard-icaseries Dieses Programm wird verwendet, um eine ICA an einer Reihe von Myokarden durchzuführen
Perfusionsbilder werden in einem Segmentierungssatz bereitgestellt, um daraus synthetische Referenzen zu erstellen
kann zur Bewegungskorrektur durch Bildregistrierung verwendet werden. Wenn das Ziel darin besteht, einen vollständigen Lauf zu absolvieren
Bewegungskompensation, dann ist es besser, mia-2dmyoica-nonrigid auszuführen, da dieses Programm vorhanden ist
Im Wesentlichen das Gleiche ohne die Registrierungsbits.
OPTIONAL
Datei-IO
-i --in-file=(Eingabe, erforderlich); Schnur
Eingabe Perfusionsdatensatz
-r --references=(Ausgabe); Zeichenfolge
Dateinamenbasis für die Referenzbilder. Bildtyp und Nummerierungsschema sind
aus den Eingabebildern entnommen.
-c --save-cropped=(Ausgabe); Zeichenfolge
Speichern Sie den zugeschnittenen Satz des Originalsatzes in dieser Datei, die von den Bilddateien verwendet wird
der Stamm des Namens als Dateinamenbasis
--save-feature=(Ausgabe); Schnur
Speichern Sie die aus dem ICA resultierenden Feature-Bilder und einige Zwischenbilder
Wird für die RV-LV-Segmentierung mit der angegebenen Dateinamenbasis in PNG-Dateien verwendet.
Speichern Sie außerdem die Koeffizienten der anfänglichen besten und der endgültigen IC-Mischung
Matrix.
Hilfe & Info
-V --verbose=Warnung
Ausführlichkeit der Ausgabe, Ausgabe von Nachrichten mit gegebenem Level und höheren Prioritäten.
Unterstützte Prioritäten beginnend auf der niedrigsten Ebene sind:
Info - Low-Level-Meldungen
Spur - Funktionsaufruf-Trace
scheitern ‐ Testfehler melden
Warnung - Warnungen
Fehler - Fehler melden
debuggen - Debug-Ausgabe
Nachricht - Normale Nachrichten
tödlich - Nur schwerwiegende Fehler melden
--Urheberrechte ©
Copyright-Informationen drucken
-h - Hilfe
diese Hilfe ausdrucken
-? --Verwendungszweck
eine kurze Hilfe ausdrucken
--Version
Versionsnummer drucken und beenden
ICA
-C --Komponenten=0
ICA-Komponenten 0 = automatische SchätzungICA-Komponenten 0 = automatisch
Schätzung
--normalisieren
normalisierte ICs
--kein Mittelstreifen
den Mittelwert nicht aus den Mischkurven entfernen
-s --segscale=1.4
segmentieren und skalieren Sie den Zuschneiderahmen um das LV-Segment (0=keine Segmentierung) und
Skalieren Sie den Zuschneiderahmen um den LV (0=keine Segmentierung)
-k --skip=0
Überspringen Sie die Bilder am Anfang der Serie, da sie von anderen stammen
Modalitäten Überspringen Sie Bilder am Anfang der Serie, da sie von anderen stammen
Modalitäten
-m --max-ica-iter=400
maximale Anzahl von Iterationen in ICAmaximale Anzahl von Iterationen in ICA
-E --segmethod=Features
Segmentierungsmethode
Delta-Spitze ‐ Differenz der Peak-Enhancement-Bilder
Funktionen - Feature-Bilder
Delta-Funktion ‐ Unterschied der Merkmalsbilder
In Bearbeitung
--threads=-1
Maximale Anzahl von Threads, die für die Verarbeitung verwendet werden sollen. Diese Anzahl sollte niedriger sein
oder gleich der Anzahl der logischen Prozessorkerne in der Maschine. (-1:
automatische Schätzung). Maximale Anzahl von Threads, die für die Verarbeitung verwendet werden sollen
Anzahl sollte kleiner oder gleich der Anzahl der logischen Prozessorkerne sein
Die Maschine. (-1: automatische Schätzung).
BEISPIEL
Werten Sie die synthetischen Referenzen aus set segment.set aus und speichern Sie sie in refXXXX.??? von
Verwendung von fünf unabhängigen Komponenten und Überspringen von 2 Bildern. Standardmäßig ein Begrenzungsrahmen
um den LV herum werden segmentiert und um 1.4 skaliert und die zugeschnittenen Bilder werden dort gespeichert
CropXXXX.??? und ein Segmentierungssatz „cropped.set“ wird erstellt. Der Bilddateityp ??? Ist
von den Eingabebildern in segment.set abgezogen.
mia-2dmyocard-icaseries -i segment.set -r ref -o ref -k 2 -C 5
AUTOR(n)
Gert Wollny
COPYRIGHT
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Option '--Urheberrecht'.
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