mincconcat - Online in der Cloud

PROGRAMM:

NAME/FUNKTION

mincconcat - Verketten Sie minc-Dateien entlang einer bestimmten Dimension

ZUSAMMENFASSUNG

minconcat [ ] .mnc [ .mnc...] .mnc

BESCHREIBUNG

Minconcat verkettet eine Reihe von minc-Dateien und erzeugt eine einzige Ausgabe
Datei. Die Verkettung erfolgt entlang einer bestimmten Dimension, wobei die Slices sortiert werden
in aufsteigender Reihenfolge. Die Verkettungsdimension kann entweder eine Dimension in der Datei sein,
in diesem Fall werden die Koordinaten für die Sortierung direkt aus den Eingabedateien übernommen, oder es kann
eine neue Dimension sein und die Koordinaten werden mit einer Befehlszeilenoption angegeben.

OPTIONAL

Beachten Sie, dass Optionen in abgekürzter Form angegeben werden können (sofern sie eindeutig sind) und
kann überall auf der Kommandozeile angegeben werden.

Allgemeines Optionen

-2 Erstellen Sie eine Ausgabedatei im MINC 2.0-Format.

-Klamotten
Überschreiben Sie eine vorhandene Datei.

-noklobber
Überschreiben Sie keine vorhandene Datei (Standard).

-verbose
Drucken Sie Fortschrittsinformationen für jeden kopierten Datenblock aus (Standard).

-ruhig Drucken Sie keine Fortschrittsinformationen aus.

-max_chunk_size_in_kb Größe
Geben Sie die maximale Größe des Kopierpuffers (in KB) an. Der Standardwert ist 4096 kByte.

-Dateiliste Dateinamen
Geben Sie eine Datei an, die eine Liste von Eingabedateinamen enthält. Wenn "-" angegeben ist, dann Datei
Namen werden aus stdin gelesen. Wenn diese Option angegeben ist, sollte keine Eingabe erfolgen
Dateinamen, die in der Befehlszeile angegeben werden. Leerzeilen in der Eingabedatei sind
ignoriert.

Output tippe Optionen

-Dateityp
Führen Sie keine Typkonvertierung durch (Standard).

-Byte Schreiben Sie 8-Bit-Integer-Voxel aus.

-kurzes Schreiben Sie 16-Bit-Integer-Voxel aus.

-int Schreiben Sie 32-Bit-Integer-Voxel aus.

-langes Ersetzt durch -int.

-schweben Schreiben Sie Gleitkommawerte mit einfacher Genauigkeit.

-doppelt
Schreiben Sie Gleitkommawerte mit doppelter Genauigkeit aus.

-unterzeichnet
Werte als vorzeichenbehaftete Ganzzahlen ausgeben (Standard für short und long). Ignoriert für
Gleitkomma-Typen.

-ohne Vorzeichen
Werte als vorzeichenlose Ganzzahlen ausgeben (Standardwert für Byte). Ignoriert für schwebend
Punkttypen bzw.

-gültiger Bereich Min. max
Gibt den gültigen Bereich der Ausgabevoxelwerte in ihrer ganzzahligen Darstellung an.
Standard ist der vollständige Bereich für Typ und Vorzeichen. Diese Option wird ignoriert für
Gleitkommawerte.

Verkettung Optionen

-concat_dimension Name
Gibt den Namen der Verkettungsdimension an. Wenn die Dimension in der Eingabe vorhanden ist
Dateien, dann werden die Koordinaten aus diesen Dateien genommen. Wenn nicht, dann ist eine neue Dimension
erstellt und die Koordinate für jede Eingabedatei wird aus den Befehlszeilenoptionen übernommen.
Standardmäßig wird die am langsamsten variierende Dimension der ersten Datei verwendet.

-Start Anfang
Gibt die Startkoordinate für die neue Bemaßung an (Standard = 0.0).

-Schritt Step
Gibt den Abstand zwischen Voxeln für die neue Dimension an (Standard = 1.0).

-Breite Breite
Gibt die (konstante) Breite jeder Probe entlang der neuen Dimension an (Standard =
keiner).

-Koordinatenliste c1,c2,...
Gibt eine durch Kommas getrennte Liste von Koordinaten entlang der neuen Dimension an.

-Breitenliste w1,w2,...
Gibt eine durch Kommas getrennte Liste von Breiten entlang der neuen Dimension an.

-Dateistarts s1, s2, ...
Gibt eine durch Kommas getrennte Liste von Offsets zu den Koordinatenursprüngen für jeden von
die in der Befehlszeile aufgelisteten Dateien. Diese Option ist nützlich, um Dateien zu verketten
entlang einer bestehenden Dimension, zum Beispiel zum Verketten mehrerer Funktionsläufe
entlang einer Zeit Abmessungen.

-check_dimensions
Überprüfen Sie, ob alle Eingabedateien übereinstimmende Stichproben in Weltdimensionen aufweisen (Standard).

-nocheck_dimensions
Ignorieren Sie alle Unterschiede zwischen den Eingabedateien bei der Stichprobenziehung von Weltdimensionen.

-aufsteigend
Koordinaten in aufsteigender Reihenfolge sortieren (Standard).

-absteigend
Koordinaten in absteigender Reihenfolge sortieren.

-verschachtelt
Platten nach Maßkoordinaten sortieren, ggf. verschachteln (Standard).

-sequentiell
Sortieren Sie die Platten nicht, sondern verketten Sie sie einfach. WARNUNG - dies zerstört die
Dimensionsinformationen entlang der verkettenden Dimension, ersetzen die Start- und
Schritt mit Null und Eins.

Generisch Optionen für alle Befehle:

-Hilfe Zusammenfassung der Befehlszeilenoptionen drucken und beenden.

-Ausführung
Geben Sie die Versionsnummer des Programms aus und beenden Sie das Programm.

Beispiele:

Um zwei Volumen mit den Dimensionen zspace, yspace, xspace zu verketten, die verschachtelt sind
Slices entlang des Zspace, können wir einfach verwenden

mincconcat Eingabe1.mnc Eingabe2.mnc Ausgabe.mnc

Wenn wir eine Reihe komprimierter (yspace, xspace) Bilder haben, die wir verketten möchten
ein gleichmäßig verteiltes Volumen, dann können wir tippen

mincconcat input1.mnc.gz input2.mnc.gz input3.mnc.gz \
input4.mnc.gz Output.mnc \
-concat_dimension zspace -start -23 -schritt 2

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