Dies ist das Befehls-Pepwheele, das im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider über eine unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
pepwheel - Zeichne ein spiralförmiges Raddiagramm für eine Proteinsequenz
ZUSAMMENFASSUNG
Pepwheel -Reihenfolge Reihenfolge -Rad boolean [-Schritte ganze Zahl] [-wendet sich ganze Zahl] -Graph Graph
-amphipathisch Umschalten -Quadrate Schnur -Diamanten Schnur -oktag Schnur
Pepwheel -Hilfe
BESCHREIBUNG
Pepwheel ist ein Kommandozeilenprogramm von EMBOSS („the European Molecular Biology Open
Software-Suite“). Es ist Teil der Befehlsgruppe(n) "Anzeige,Protein:2D-Struktur".
OPTIONAL
Eingang Abschnitt
-Reihenfolge Reihenfolge
Ausgang Abschnitt
-Rad boolean
Standardwert: Y
-Schritte ganze Zahl
Die Anzahl der pro Umdrehung aufgetragenen Reste ist dieser Wert dividiert durch den 'Turns'-Wert.
Standardwert: 18
-wendet sich ganze Zahl
Die Anzahl der pro Umdrehung aufgetragenen Reste ist der "Schritte"-Wert dividiert durch diesen Wert.
Standardwert: 5
-Graph Graph
Markup Abschnitt
-amphipathisch Umschalten
Wenn dies zutrifft, werden die Reste ACFGILMVWY als Quadrate und alle anderen markiert
Rückstände sind unmarkiert. Dies überschreibt alle anderen Markups, die Sie möglicherweise angegeben haben
mit den Qualifiern '-squares', '-diamonds' und '-octags'.
-Quadrate Schnur
Standardmäßig sind die aliphatischen Reste ILVM mit Quadraten markiert. Standardwert: ILVM
-Diamanten Schnur
Standardmäßig sind die Reste DENQST mit Rauten markiert. Standardwert: DENQST
-oktag Schnur
Standardmäßig sind die positiv geladenen Reste HKR mit Achtecken markiert. Standard
Wert: HKR
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