Dies ist der Befehl plotcone, der im kostenlosen OnWorks-Hosting-Provider mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, Windows-Online-Emulator oder MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
plotcon - Ploterhaltung eines Sequenz-Alignments
ZUSAMMENFASSUNG
Plotcon -Sequenzen Folgesatz [-Scorefile Matrix] -winsize ganze Zahl -Graph Xygraph
Plotcon -Hilfe
BESCHREIBUNG
Plotcon ist ein Kommandozeilenprogramm von EMBOSS („the European Molecular Biology Open
Software-Suite“). Es ist Teil der Befehlsgruppe(n) "Ausrichtung:Mehrfach".
OPTIONAL
Eingang Abschnitt
-Sequenzen Folgesatz
Datei mit einem Sequenz-Alignment
-Scorefile Matrix
Dies ist die Bewertungsmatrixdatei, die beim Vergleichen von Sequenzen verwendet wird. Standardmäßig ist es der
Datei 'EBLOSUM62' (für Proteine) oder die Datei 'EDNAFULL' (für Nukleinsequenzen). Diese
Dateien befinden sich im Verzeichnis 'data' der EMBOSS-Installation.
Erforderlich Abschnitt
-winsize ganze Zahl
Anzahl der Spalten bis zur durchschnittlichen Ausrichtungsqualität. Je größer dieser Wert ist, desto
glatter wird die Handlung sein. Standardwert: 4
Ausgang Abschnitt
-Graph Xygraph
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