Dies ist die Befehlsreparatur, die beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks mit einer unserer zahlreichen kostenlosen Online-Workstations wie Ubuntu Online, Fedora Online, dem Windows-Online-Emulator oder dem MAC OS-Online-Emulator ausgeführt werden kann
PROGRAMM:
NAME/FUNKTION
Repair – eine Komponente der Subread-Suite
ANWENDUNG
Knorpel zu reparieren, [Optionen] -i -o
Erforderliche Argumente:
-i
Name der Eingabedatei. Standardmäßig BAM-Format.
-o
Name der Ausgabedatei. Die Ausgabedatei liegt im BAM-Format vor.
Optionale Argumente:
-S Die Eingabedatei liegt im SAM-Format vor.
-c Komprimieren Sie die ausgegebene BAM-Datei. Dadurch wird die Größe der BAM-Datei reduziert
Erhöhen Sie die Zeit zum Abrufen von Lesevorgängen aus der BAM-Datei.
-T
Anzahl der CPU-Threads. 8 standardmäßig.
-d Fügen Sie keine Dummy-Lesevorgänge für Singleton-Lesevorgänge hinzu.
-t Fügen Sie keine Sequenzen und Qualitätsbewertungen von Lesevorgängen in die Ausgabedatei ein.
Nutzen Sie die Online-Reparatur über die Dienste von onworks.net
