Dies ist die Linux-App namens Allelome.PRO, deren neueste Version als Allelome.PRO_original_NAR_2015.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Allelome.PRO mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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Allelome.PRO
BESCHREIBUNG
Die Erkennung allelischer Verzerrungen anhand von Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten erfordert einen Ansatz, der die Ergebnisse maximiert
Empfindlichkeit bei gleichzeitiger Minimierung falsch positiver Ergebnisse. Hier präsentieren wir Allelome.PRO, ein automatisiertes, benutzerfreundliches
Bioinformatik-Pipeline, die Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten aus reziproken Kreuzungen verwendet
von zwei genetisch unterschiedlichen Mausstämmen zum Nachweis der allelspezifischen Expression und des Chromatins
Modifikationen. Allelome.PRO erweitert Ansätze, die in früheren Studien verwendet wurden, in denen ausschließlich Analysen durchgeführt wurden
Eingeprägter Ausdruck, um durch automatische Kategorisierung ein vollständiges Bild des „Alleloms“ zu erhalten
allelische Expression aller Gene in einem bestimmten Zelltyp in geprägte, stammabhängige biallelische oder nichtinformative Gene.
Allelome.PRO bietet eine erhöhte Empfindlichkeit für die gemeinsame Analyse schwach exprimierter Transkripte
mit einer robusten Falscherkennungsrate, die empirisch aus Variationen in den Sequenzierungsdaten berechnet wird.
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Befehlszeile
Programmiersprache
Unix-Shell, Perl, S/R
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/allelomepro/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
