Dies ist die Linux-App namens CAMPARI zur Ausführung unter Linux online, deren neueste Version als campari_v3_09052017.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens CAMPARI herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
CAMPARI läuft unter Linux online
Ad
BESCHREIBUNG
Wir sind stolz, Version 3 von CAMPARI vorstellen zu können. Dies ist ein großer Fortschritt gegenüber Version 2, vor allem aufgrund der umfassenden OpenMP-Unterstützung (Threads-Parallelität) und aufgrund erheblicher Verbesserungen sowohl bei der Benutzerfreundlichkeit als auch bei der Leistung. Wir haben auch wieder eine Reihe neuer Algorithmen aus der neueren Literatur hinzugefügt, und CAMPARI unterstützt natürlich weiterhin das ABSINTH-Kraftfeldparadigma und das implizite Solvatationsmodell.CAMPARI ist ein gemeinsames Paket zur Durchführung und Analyse molekularer Simulationen, insbesondere von Polymeren mit biologischer Relevanz. Es konzentriert sich auf eine breite Verfügbarkeit von Algorithmen für die (fortgeschrittene) Probenahme und ist in der Lage, Monte-Carlo- und molekulardynamische Probenahme nahtlos zu kombinieren. CAMPARI bietet dem Benutzer ein sehr hohes Maß an Kontrolle über alle implementierten Funktionen. Weitere Informationen und Funktionen finden Sie auf der Homepage des Projekts unter http://campari.sourceforge.net. Version 2 wird nicht mehr aktiv gepflegt, die endgültige Version ist jedoch weiterhin verfügbar.
Eigenschaften
- Kombinierte MC- und MD-Probenahme, MD im kartesischen oder Torsions-/Starrkörperraum
- Effiziente OpenMP-Parallelisierung aller Kernenergie-/Kraftroutinen
- On-the-fly-Analyse oder Ausführung als Trajektorienanalyse-Tool (auch parallel)
- Viele integrierte Analyseroutinen (DSSP, Kontaktkarten, Paarkorrelationsfunktionen usw.)
- Unterstützung für mehrere strukturelle Clustering- und verwandte Algorithmen sowie Markov-Zustandsmodellanalysen
- Vollständig dokumentiert (HTML) und zusätzlich mit 13 Tutorials ausgeliefert
- Sehr hohes Maß an Kontrolle (z. B. benutzerdefinierte holonome Einschränkungen in MD)
- Umfangreiche Unterstützung für parallele Multi-Replica-Simulationstechniken wie Replikataustausch bei hybrider MPI/OpenMP-Parallelausführung
- Eigenständige Analyseeinrichtung für die Clustering-/Markov-Zustandsmodelleinrichtungen
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Konsole/Terminal
Programmiersprache
Fortran
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/campari/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
