Dies ist die Linux-App namens CoVEC, deren neueste Version als covec_distribution-v0.4.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations betrieben werden.
Laden Sie diese App mit dem Namen CoVEC with OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
CoVEC
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BESCHREIBUNG
Das Paket stellt SVM-Modelle zur Verwendung mit SVMlight bereit (http://svmlight.joachims.org/), um aus einzelnen Vorhersagen Dritter einen Konsens über die Auswirkungen von Mutationen zu ziehen. Die Tools von Drittanbietern sind SIFT, Polyphen3, SNPs&GO und Mutation Assessor.
Das Paket enthält außerdem eine Reihe von Perl-Modulen und -Skripten, die bei der Datenaufbereitung helfen. Die Module können zum Erstellen benutzerdefinierter Tools und Pipelines verwendet werden, während die Skripte grundlegende ausführbare Implementierungen basierend auf den Modulen bereitstellen.
SVMlight, SIFT, Polyphen2, SNPs&GO und Mutation Assessor sind Eigentum ihrer jeweiligen Autoren und Institutionen und werden nicht in diesem Paket verteilt.
Publikum
Gesundheitswirtschaft, Wissenschaft/Forschung, Entwickler
Benutzeroberfläche
Konsole/Terminal, Befehlszeile
Programmiersprache
Perl
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/covec/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
