Dies ist die Linux-App namens easy-dhpsf, die online unter Linux ausgeführt werden kann und deren neueste Version als easy-dhpsf_v2_1.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens easy-dhpsf herunter und führen Sie sie online aus, um sie online mit OnWorks kostenlos unter Linux auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
easy-dhpsf zur Online-Ausführung unter Linux
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BESCHREIBUNG
Dieses Paket von MATLAB-Routinen mit begleitender GUI ermöglicht es wissenschaftlichen Benutzern, die 3D-Position einzelner Moleküle zu messen, wenn sie das Weitfeldmikroskop mit Doppelhelix-Punktspreizfunktion (DH-PSF) verwenden. Version 2 enthält auch Code, der das Kombinieren von Lokalisierungsdaten aus zwei Spektralkanälen mithilfe einer lokal gewichteten quadratischen 3D-Registrierungsfunktion ermöglichtEigenschaften
- Der Doppel-Gauss-Schätzer wird über einen axialen Scan von hellen immobilen fluoreszierenden Emittern (zB Beads) kalibriert
- Die DH-Lokalisierung erfolgt durch Template-Matching und anschließende doppelte Gaussian-Anpassung
- Tiff-Stapel von SM-Bildern werden mithilfe von Template-Matching und anschließendem Double-Gauss-Fitting analysiert, um Schätzungen der Molekülpositionen zu extrahieren
- Zwei Spektralkanäle werden registriert, indem eine lokal gewichtete quadratische Abbildungsfunktion aus Passpunktpaaren generiert wird
Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
MATLAB
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/easy-dhpsf/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
