Dies ist die Linux-App namens Hamstr, deren neueste Version als hamstr.v13.2.6-bin-lib.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Hamstr mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
Hamstr
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BESCHREIBUNG
HaMStR ist umgezogen https://github.com/bionf/hamstr wo es jetzt Teil des HaMStR-OneSeq-Pakets ist.
HaMStR ist ein Profil-Hidden-Markov-Modell-basiertes Tool für eine gerichtete Orthologensuche in EST- oder Proteinsequenzdaten. Das Programm verwendet eine vordefinierte Kerngruppe orthologer Sequenzen (Kernorthologe) und einen Satz Sequenzen aus einem Suchtaxon als Eingabe. HaMStR kombiniert dann in einer zweistufigen Strategie eine pHMM-basierte Suche und eine umgekehrte Suche über BLAST, um die Kernorthologengruppe mit neuen Sequenzen aus dem Suchtaxon zu erweitern.
Publikum
Wissenschaftsforschung
Programmiersprache
Perl
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/hamstr/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
