Dies ist die Linux-App namens High-Throughput Tabular Data Processor, deren neueste Version als htdpinstaller.exe heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App mit dem Namen „High-Throughput Tabular Data Processor“ mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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Tabellendatenprozessor mit hohem Durchsatz
BESCHREIBUNG
HIGH-THROUGHPUT TABULAR DATA PROCESSOR (HTDP) ist eine Java-Anwendung, die Datenexplorations- und -reduzierungsaufgaben in großen Textdateien erleichtern soll, die aus Hochdurchsatztechnologien resultieren, z. B. massiv parallele Sequenzierung oder Microarrays. Die Software wurde für Microarray- und Deep-Parallel-Sequencing-Daten optimiert, kann jedoch alle durch Zeichen getrennten Tabellendatensätze akzeptieren. HTDP kann auch Dateien im Variant Call Format (VCF) Version importieren, verarbeiten und konvertieren. 4.0, 4.1 und 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
HTDP bietet schnelle Filterfunktionen und kann Daten verarbeiten, die aus einzelnen oder mehreren Eingabedateien bestehen.
Zitat: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) High-Throughput Tabular Data Processor – Plattformunabhängiges grafisches Tool zur Verarbeitung großer Datenmengen. PLoS ONE 13(2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
Eigenschaften
- funktioniert mit allen durch Zeichen getrennten Spaltendaten (z. B. BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- Führen Sie tabellarische Datendateien vertikal und horizontal zusammen
- Führen Sie alle tabellarischen Datendateien anhand des Genomstandorts oder gemeinsamer Spalten zusammen.
- unbegrenzte Filter- und Datenreduzierungsfunktionen
- Es können unterschiedliche Dateien hinsichtlich Format und Inhalt gleichzeitig analysiert werden
Programmiersprache
Javac
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/htdp/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
