Dies ist die Linux-App namens MARAGAP, deren neueste Version als Data-Maragap.rar heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MARAGAP mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
MARAGAP
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BESCHREIBUNG
In diesem Artikel wird „MARAGAP“ vorgestellt, eine referenzgestützte Genomassemblierungspipeline. MARAGAP verwendet das Prinzip der minimalen Beschreibungslänge, um die optimale Referenzsequenz für die Baugruppe zu bestimmen. Die optimale Referenzsequenz wird als Vorlage verwendet, um Inversionen, Insertionen, Deletionen und SNPs im Zielgenom abzuleiten. MARAGAP verwendet einen algorithmischen Ansatz zur Erkennung und Korrektur von Inversionen und Löschungen, einen auf De-Bruijn-Graphen basierenden Ansatz zur Ableitung der Einfügungen, ein lokales Affine-Match-Affin-Gap-Alignment-Tool zur Schätzung der Positionen dieser Einfügungen und ein Bayesianisches Schätzsystem für SNPs.Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/refasp/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
