Dies ist die Linux-App namens MaxBin2, deren neueste Version als MaxBin-2.2.7.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MaxBin2 mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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MaxBin2
BESCHREIBUNG
MaxBin2 ist die nächste Generation von MaxBin (https://sourceforge.net/projects/maxbin/), das mehrere Samples gleichzeitig unterstützt. MaxBin ist eine Software zum Binning von zusammengesetzten metagenomischen Sequenzen basierend auf einem Expectation-Maximization-Algorithmus. Benutzer könnten die zugrunde liegenden Bins (Genome) der Mikroben in ihren Metagenomen verstehen, indem sie einfach zusammengestellte metagenomische Sequenzen und die Reads-Coverage-Informationen oder Sequenzierungs-Reads bereitstellen. Der Benutzerfreundlichkeit halber wird MaxBin genombezogene Statistiken, einschließlich der geschätzten Vollständigkeit, des GC-Gehalts und der Genomgröße, auf der Binning-Zusammenfassungsseite melden. Benutzer können MEGAN oder eine ähnliche Software für MaxBin-Bins verwenden, um die Taxonomie jedes Bins herauszufinden, nachdem der Binning-Prozess abgeschlossen ist.Weitere Informationen finden Sie auf der offiziellen MaxBin-Website: http://downloads.jbei.org/data/microbial_communities/MaxBin/MaxBin.html
Eigenschaften
- Metagenomik-Binning
Programmiersprache
C + +
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/maxbin2/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
