Dies ist die Linux-App namens mCarts, die unter Linux online ausgeführt werden kann und deren neueste Version als mCarts.v1.2.0.tgz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens mCarts herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
mCarts für die Online-Ausführung unter Linux
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BESCHREIBUNG
Viele RBPs erkennen sehr kurze und degenerierte Sequenzen, wobei die Targeting-Spezifität durch Mechanismen wie die synergistische Bindung an mehrere geclusterte Stellen und die Modulation der Stellenzugänglichkeit durch verschiedene RNA-Sekundärstrukturen erreicht wird. mCarts integriert die Anzahl und den Abstand einzelner Motivstandorte sowie deren Zugänglichkeit und Erhaltung, was das Signal-Rausch-Verhältnis erheblich verbessert. Dieser Algorithmus lernt und quantifiziert die Regeln dieser Merkmale und nutzt dabei eine große Anzahl von In-vivo-RBP-Bindungsstellen, die aus der Hochdurchsatzsequenzierung von durch Vernetzung und Immunpräzipitation isolierten RNAs (HITS-CLIP) stammen. Wir haben diesen Algorithmus angewendet, um zwei repräsentative RBPs, Nova und Mbnl, zu untersuchen. Trotz des sehr geringen Informationsgehalts in einzelnen Motivelementen traf unser Algorithmus sehr spezifische Vorhersagen für eine erfolgreiche experimentelle Validierung.Publikum
Wissenschaft/Forschung, fortgeschrittene Endbenutzer
Benutzeroberfläche
Befehlszeile
Programmiersprache
Perl
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mcarts/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
