Dies ist die Linux-App namens MiModD, deren neueste Version als MiModD-0.1.9.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MiModD mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
Ad
MiModD
BESCHREIBUNG
MiModD ist ein Softwarepaket zur Identifizierung genomischer Varianten aus Next-Generation-Sequencing (NGS)-Daten mit optimierter Nutzung der Systemressourcen und einer benutzerfreundlichen Oberfläche. Für die meisten Genome von Modellorganismen ermöglicht es dem Benutzer, innerhalb weniger Stunden eine vollständige Analyse von nicht ausgerichteten genomischen NGS-Lesedaten bis hin zu einer annotierten Variantenliste auf einem normalen Desktop-PC durchzuführen. Die Benutzeroberfläche ist anfängerfreundlich und soll Genetiker dazu ermutigen, NGS-Daten selbst ohne die Hilfe eines ausgebildeten Bioinformatikers zu analysieren.
Eigenschaften
- WGS-Analyse von Genomen von Modellorganismen auch auf einzelnen PCs und Notebooks
- leistungsstarke Tools für Variantenfilterung und -zuordnung
- Integration in eine bestehende Galaxy-Installation mit einem einzigen Befehl
- Beispieldatensätze zum Testen
- Online-Tutorial und umfangreiche Dokumentation
- plattformspezifische gebündelte Distributionen (viele Linux-Varianten, OS X) zum Ausführen und Testen in einer vorkonfigurierten Galaxy-Instanz ohne Installation
Publikum
Wissenschaft/Forschung, fortgeschrittene Endbenutzer
Benutzeroberfläche
Webbasiert, Befehlszeile
Programmiersprache
Python
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mimodd/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
