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Verschiedene Genomik-Tools zum Herunterladen für Linux

Laden Sie die Linux-App „Misc Genomics Tools“ kostenlos herunter, um sie online in Ubuntu online, Fedora online oder Debian online auszuführen

Dies ist die Linux-App mit dem Namen misc genomics tools, deren neueste Version als misc_genomics_tools_v0.2.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.

Laden Sie diese App namens „Misc Genomics Tools“ mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.

Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:

- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.

- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.

- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.

- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.

- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.

- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.

SCREENSHOTS

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Verschiedene Genomik-Tools


BESCHREIBUNG

Hierbei handelt es sich um eine Sammlung verschiedener Programme, die im Rahmen eines Genomikprojekts mit dem Pseudomonas-Stamm NCIMB10586 entwickelt wurden
Diese Dienstleistungen umfassen
* Identifizieren und Korrigieren von Fehlern in einer (z. B.) Pacbio-Genomsequenz mithilfe von Illumina-Reads
* Annotation der prokaryotischen Sequenz/Genom
* RNAseq-Analyse – Normalisierung und Zusammenstellung mehrerer Proben als Gruppe
* RNAseq-Visualisierung

Alle Skripte werden nach bestem Wissen und Gewissen bereitgestellt. Aufgrund verschiedener Systemänderungen kann ich jedoch nicht garantieren, dass alle Dateien die in der Analyse verwendete Version haben.
Bitte beachten Sie auch, dass diese vor allem mit Blick auf Zweckmäßigkeit entwickelt wurden – das heißt, es wurde erwartet, dass der Prozess einmal in seiner endgültigen Form durchgeführt wird; Es wurde wenig Wert darauf gelegt, die Laufzeit zu optimieren oder Skripte miteinander zu verketten, und manchmal wird manuell auf externe Ressourcen zugegriffen.



Eigenschaften

  • Korrektur von Genomsequenzfehlern
  • Anmerkung zur prokaryotischen Sequenz
  • RNAseq-Normalisierung mehrerer Proben als Gruppe
  • RNAseq-Probenserie/Zeitverlaufsvisualisierung


Publikum

Wissenschaftsforschung



Programmiersprache

Perl


Kategorien

Bioinformatik

Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.


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