Dies ist die Linux-App namens MPprimer, deren neueste Version als MPprimer-1.5-macOS-64.tar.bz2 heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MPprimer mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
MPprimer
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BESCHREIBUNG
Hintergrund: Multiplex-PCR, definiert als die gleichzeitige Amplifikation mehrerer Regionen einer DNA-Matrize unter Verwendung von mehr als einem Primersatz (bestehend aus einem Vorwärtsprimer und einem Rückwärtsprimer) in einem Röhrchen, wird in klinischen und umweltmikrobiologischen Studien häufig eingesetzt. Allerdings ist das Primerdesign für die Multiplex-PCR immer noch ein herausforderndes Problem und mehrere Faktoren müssen berücksichtigt werden. Zu diesen Problemen gehören Fehlpriming aufgrund unspezifischer Bindung an Nicht-Ziel-DNA-Matrizen, Primer-Dimerisierung und die Unfähigkeit, DNA-Amplikons mit ähnlicher elektrophoretischer Mobilität zu trennen und zu reinigen.
Ergebnisse: Ein neues Programm namens MPprimer wurde entwickelt, um Benutzern dabei zu helfen, Primer-Sets für die Multiplex-PCR mit hoher Zuverlässigkeit zu entwerfen. Es verwendet das weit verbreitete Primer-Designprogramm Primer3 und das Primer-Spezifitätsbewertungsprogramm MFEprimer, um die Kandidaten-Primer auf der Grundlage einer Genom- oder Transkript-DNA-Datenbank zu entwerfen und zu bewerten, gefolgt von einer sorgfältigen Prüfung, um eine Primer-Dimerisierung zu vermeiden.
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mpprimer/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
