Dies ist die Linux-App namens MToolBox, die online unter Linux ausgeführt werden kann und deren neueste Version als MToolBox.v0.3.3.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MToolBox herunter und führen Sie sie online aus, um sie online mit OnWorks kostenlos unter Linux auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
MToolBox zur Online-Ausführung unter Linux
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BESCHREIBUNG
MToolBox ist eine hochautomatisierte Bioinformatik-Pipeline zur Rekonstruktion und Analyse menschlicher mitochondrialer DNA aus Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten. MToolBox enthält eine aktualisierte Rechenstrategie zum Zusammenbau mitochondrialer Genome aus Whole Exome und/oder Genome Sequencing (PMID: 22669646) und ein verbessertes Fragmentklassifizierungstool (PMID: 22139932) für die Haplogruppenzuordnung, Funktions- und Priorisierungsanalyse mitochondrialer Varianten. MToolBox bietet Pathogenitäts-Scores, Profile der Genomvariabilität und Krankheitsassoziationen für mitochondriale Varianten. MToolBox bietet auch eine Variant Call Format-Datei (Version 4.0), die zum ersten Mal Allel-spezifische Heteroplasmie enthält.Bitte überprüfen Sie die neuesten Updates des Quellcodes mit dem Github-Repository von MToolBox:
https://github.com/mitoNGS/MToolBox
oder besuchen Sie die Webversion von MToolBox @ MSeqDR:
https://mseqdr.org/mtoolbox.php
Programmiersprache
Unix-Shell, Python
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mtoolbox/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
