Dies ist die Linux-App namens MutaNET, deren neueste Version als MutaNET-v1.1.2.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens MutaNET mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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MutaNET
BESCHREIBUNG
MutaNET wird mit einer Next-Generation-Sequencing-Pipeline (NGS) geliefert, die Mutationen basierend auf Paired-End-NGS-Reads aufruft, einem automatisierten Mutationsanalyse-Tool und verschiedenen Dateikonvertern und -fusionen. Die Mutationsanalysefunktion berücksichtigt die kodierende Region, Proteindomänen, Regulations- und Transkriptionsfaktor-Bindungsstelleninformationen und kann verwendet werden, um den potenziellen Einfluss von Mutationen auf die Antibiotikaresistenz zu analysieren.
Eigenschaften
- Calling-Pipeline für NGS-Varianten
- automatisierte Mutationsanalyse
- Genregulatorische Netzwerkanalyse
- Gene von Interesse definieren
- Mutationen in der kodierenden Region
- Transkriptionsfaktor-Bindungsseitenmutationen
- Mutationen der Proteindomäne
- Dateiformatkonverter
Publikum
Gesundheitswirtschaft, Wissenschaft/Forschung
Programmiersprache
Python
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/mutanet/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
