Dies ist die Linux-App namens NeedlemanWunsch, deren neueste Version als Needleman_wunsch-0.3.5.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens NeedlemanWunsch mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
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NeedlemanWunsch
BESCHREIBUNG
NACH GITHUB VERSCHOBEN: https://github.com/noporpoise/seq-align
Globale optimale Sequenzausrichtung mit dem Needleman-Wunsch-Algorithmus.
Richtet DNA, RNA, Proteinsequenz und mehr aus!
Sehen Sie sich unser Schwesterprojekt zur lokalen Ausrichtung mit Smith-Waterman an:
http://sourceforge.net/projects/smithwaterman/
Eigenschaften
- Strafen für affine Lücken
- Für Lücken am Anfang und Ende von Ausrichtungen kann keine Lückenstrafe festgelegt werden
- Farbige Ausgabe
- Liest FASTA-, FASTQ- und einfache Sequenzdateien (einschließlich gzip-Dateien)
- Voreingestellte DNA-/Protein-Substitutionsmatrizen (PAM/BLOSUM usw.)
- Kann Ersatz-Strafmatrizen laden
- Tragbarer C-Code, der in anderen Bioinformatikprojekten verwendet werden kann
Publikum
Wissenschaft/Forschung, Bildung
Benutzeroberfläche
Konsole/Terminal, Befehlszeile
Programmiersprache
C ++, c
Kategorien
Hierbei handelt es sich um eine Anwendung, die auch unter https://sourceforge.net/projects/needlemanwunsch/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
