Dies ist die Linux-App namens ParDRe, deren neueste Version als ParDRe-rel2.2.5.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens ParDRe mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
ParDRe
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BESCHREIBUNG
ParDRe ist ein paralleles Tool zum Entfernen doppelter Lesevorgänge. Doppelte Lesevorgänge können als identisch angesehen werden
oder nahezu identische Sequenzen mit einigen Fehlpaarungen. Dieses Tool ermöglicht es den Benutzern, die Analyse nicht notwendiger Lesevorgänge zu vermeiden, wodurch die Zeit nachfolgender Prozeduren mit dem Datensatz (z. B. Baugruppen, Mappings usw.) verkürzt wird.
Das Tool ist mit MPI implementiert, um die parallelen Fähigkeiten von Multicore zu nutzen
Cluster. Es ist bei gleicher Anzahl von Kernen schneller als Multithread-Pendants (Ende 2015) und kann dank der Message-Passing-Technologie auf Clustern ausgeführt werden.
Es gibt auch ein MapReduce-Pendant von ParDRe, genannt MarDRe (siehe Link oben).
UPDATE: Ab Version 2.0.5 bietet ParDRe auch Unterstützung, um nur optische Duplikate zu entfernen (und biologisch interessante Duplikate zu hinterlassen) sowie mit komprimierter Ein-/Ausgabe im .gz-Format zu arbeiten.
Publikum
Informationstechnologie, Gesundheitswirtschaft, Wissenschaft/Forschung
Benutzeroberfläche
Konsole/Terminal, Befehlszeile
Programmiersprache
C + +
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/pardre/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
