Dies ist die Linux-App namens Seal, deren neueste Version als seal-0.4.0-rc2.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Seal with OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
Seal
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BESCHREIBUNG
Seal ist ein Hadoop-basiertes verteiltes Short-Read-Alignment- und Analyse-Toolkit. Derzeit umfasst Seal Tools für: Demultiplexierung von Lesevorgängen, Ausrichtung von Lesevorgängen, Entfernung doppelter Lesevorgänge, Sortierung von Lesezuordnungen und Berechnung von Statistiken für die Neukalibrierung der empirischen Basisqualität. Siegelwaagen, einfache Handhabung von TB Daten.Eigenschaften
- Short-Read-Alignment (basierend auf BWA)
- doppelte Leseidentifikation
- Lesezuordnungen sortieren
- Berechnen Sie empirische Basisqualitäts-Rekalibrierungstabellen
- schnell, skalierbar, zuverlässig (läuft auf Hadoop)
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/biodoop-seal/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
