Dies ist die Linux-App mit dem Namen SOAPdenovo2, deren neueste Version als SOAPdenovo2-src-r240.tgz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens SOAPdenovo2 mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SOAPdenovo2
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BESCHREIBUNG
Was kommt als nächstes mit SOAPdenovo2:
MEGAHIT ist der formelle Nachfolger von SOAPdenovo2
MEGAHIT: Eine ultraschnelle Einzelknotenlösung für die Zusammenstellung großer und komplexer Metagenomikdaten mithilfe eines prägnanten de Bruijn-Graphen
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25609793
https://github.com/voutcn/megahit
Neuester Code auf GitHub:
https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2
SOAPdenovo ist eine neuartige Short-Read-Assemblierungsmethode, mit der ein De-novo-Entwurfsassembly für Genome in Menschengröße erstellt werden kann. Das Programm ist speziell für die Zusammenstellung von kurzen Illumina-Reads konzipiert. Es schafft neue Möglichkeiten für den Aufbau von Referenzsequenzen und die kosteneffiziente Durchführung präziser Analysen unerforschter Genome. SOAPdenovo2 ist der Nachfolger von SOAPdenovo. Zitieren Sie den in GigaScience veröffentlichten Artikel (siehe Website unten), wenn Sie SOAPdenovo2 zitieren möchten.
Publikum
Wissenschaft/Forschung, Entwickler
Benutzeroberfläche
Befehlszeile
Programmiersprache
C ++, c
Datenbankumgebung
Flachdatei
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/soapdenovo2/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
