Dies ist die Linux-App mit dem Namen SWAPHI-LS: Alignment on Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens SWAPHI-LS: Alignment on Xeon Phi Cluster herunter und führen Sie sie online aus, um sie unter Linux online mit OnWorks kostenlos auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SWAPHI-LS: Ausrichtung auf Xeon Phi Cluster zur Ausführung unter Linux online
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BESCHREIBUNG
Der erste parallele Smith-Waterman-Algorithmus, der Intel Xeon Phi-Cluster nutzt, um die Ausrichtung langer DNA-Sequenzen zu beschleunigen. Dieser Algorithmus ist in C++ (mit einer Reihe von intrinsischen SIMD-Erweiterungen), OpenMP und MPI geschrieben. Die Leistungsbewertung ergab, dass unser Algorithmus eine sehr stabile Leistung erzielt und eine Leistung von bis zu 30.1 GCUPS auf einem einzelnen Xeon Phi und bis zu 111.4 GCUPS auf vier Xeon Phis, die sich einen Host teilen, liefert.Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Konsole/Terminal, Befehlszeile
Programmiersprache
C + +
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/swaphi-ls/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
