Dies ist die Linux-App namens SWAPHI: Smith-Waterman auf Intel Xeon Phi, deren neueste Version als swaphi-v1.0.5.tar.gz heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens SWAPHI: Smith-Waterman auf Intel Xeon Phi mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SWAPHI: Smith-Waterman auf Intel Xeon Phi
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BESCHREIBUNG
Der erste parallele Algorithmus zur Beschleunigung der Smith-Waterman-Proteindatenbanksuche auf mehreren gemeinsam genutzten Intel Xeon Phi-Coprozessoren. Durch die Suche in der UniProtKB/TrEMBL-Datenbank erreicht SWAPHI eine Leistung von bis zu 58.8 Milliarden Zellaktualisierungen pro Sekunde (GCUPS) auf einem einzelnen Xeon Phi und bis zu 228.4 GCUPS auf vier Xeon Phi.
Publikum
Wissenschaft/Forschung, Bildung, Ingenieurwesen
Benutzeroberfläche
.NET/Mono, Konsole/Terminal
Programmiersprache
C++, ALGOL 68
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/swaphi/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.