Dies ist die Linux-App namens VIGOR3, die online unter Linux läuft und deren neueste Version als VIGOR3.tgz heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens VIGOR3 herunter und führen Sie sie online aus, um sie online mit OnWorks kostenlos unter Linux auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie den OnWorks Linux-Online- oder Windows-Online-Emulator oder den MACOS-Online-Emulator von dieser Website.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Linux-Betriebssystem aus unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter, installieren Sie sie und führen Sie sie aus.
SCREENSHOTS
Ad
VIGOR3 läuft unter Linux online
BESCHREIBUNG
VIGOR ist ein Werkzeug zur Annotation von kodierenden Genen in viralen Genomen. Es wurde von Jeffrey Hoover und Shiliang Wang für das JCVI Genomic Sequencing Center for Infectious Diseases (GSCID) entwickelt.http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1471-2105-11-451.pdf
Kontakt:
Jeff Hoover
301-540-7858
[E-Mail geschützt]
Eigenschaften
- versteht RNA-Editing, ribosomale Slippage, Stop-Codon-Read-Thru & alternative Start-Codons
- annotiert reife Peptide auf Polyproteinen
- verarbeitet gespleißte, überlappende und eingebettete Gene
- handhabt zirkuläre, partielle und Entwurfsgenome (mit Lücken)
- diagnostiziert Frameshifts in der Montage
- enthält Referenzdatensätze für mehr als 50 Arten
- enthält Werkzeuge zum Erstellen neuer Referenzdatensätze
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Befehlszeile
Programmiersprache
Perl
Datenbankumgebung
SQLite
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/vigor3/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
