Dies ist die Windows-App namens Alphafold, deren neueste Version als Alphafoldv2.3.2.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations betrieben werden.
Laden Sie diese App namens Alphafold mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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Alphafach
BESCHREIBUNG
Dieses Paket bietet eine Implementierung der Inferenzpipeline von AlphaFold v2.0. Dies ist ein völlig neues Modell, das in CASP14 eingetragen und in Nature veröffentlicht wurde. Der Einfachheit halber bezeichnen wir dieses Modell im weiteren Verlauf dieses Dokuments als AlphaFold. Jede Veröffentlichung, die Erkenntnisse aus der Verwendung dieses Quellcodes oder der Modellparameter offenlegt, sollte das AlphaFold-Papier zitieren. Eine detaillierte Beschreibung der Methode finden Sie auch in den Ergänzenden Informationen. Sie können eine leicht vereinfachte Version von AlphaFold mit diesem Colab-Notebook oder von der Community unterstützte Versionen verwenden. Die Gesamtdownloadgröße für die vollständigen Datenbanken beträgt etwa 415 GB und die Gesamtgröße im entpackten Zustand beträgt 2.2 TB. Bitte stellen Sie sicher, dass Sie über genügend Festplattenspeicher, Bandbreite und Zeit zum Herunterladen verfügen. Wir empfehlen die Verwendung einer SSD für eine bessere Leistung bei der genetischen Suche.
Eigenschaften
- AlphaFold benötigt zur Ausführung mehrere genetische (Sequenz-)Datenbanken
- Während der AlphaFold-Code unter der Apache 2.0 License lizenziert ist, werden die AlphaFold-Parameter für die nicht-kommerzielle Nutzung zur Verfügung gestellt
- 5 Modelle, die während CASP14 verwendet und umfassend auf die Qualität der Strukturvorhersage validiert wurden
- 5 pTM-Modelle, die fein abgestimmt wurden, um pTM . zu produzieren
- Die einfachste Möglichkeit, AlphaFold auszuführen, ist die Verwendung des mitgelieferten Docker-Skripts
- Standardmäßig versucht Alphafold, alle sichtbaren GPU-Geräte zu verwenden
Programmiersprache
Python
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/alphafold.mirror/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
