Dies ist die Windows-App namens COV2HTML, die unter Windows online über Linux online ausgeführt werden kann. Die neueste Version kann als map2cov_4.4_SRC.zip heruntergeladen werden. Sie kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens COV2HTML herunter und führen Sie sie online aus, um sie kostenlos unter Windows online über Linux online mit OnWorks auszuführen.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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COV2HTML kann unter Windows online über Linux online ausgeführt werden
BESCHREIBUNG
COV2HTML bietet Biologen eine einfache Weboberfläche für zu Hause, die eine Abdeckungsvisualisierung der für die Analyse erforderlichen NGS-Ausrichtung ermöglicht. Es kombiniert zwei wesentliche Prozesse: (i) MAP2COV, ein Tool, das die riesigen NGS-Kartierungs- oder Abdeckungsdateien in lichtspezifische Abdeckungsdateien umwandelt, die Informationen zu genetischen Elementen enthalten. (ii) COV2HTML, eine Visualisierungsschnittstelle, die eine Echtzeitanalyse von Daten mit ausgewählten Kriterien ermöglicht. Somit bietet diese Schnittstelle eine Visualisierung von NGS-Mapping-Coverage-Daten (DNA-seq, RNA-seq, ChIP-seq und TSS), die in verschiedenen prokaryotischen Organismen (Bakterien, Viren ...) oder unter verschiedenen experimentellen Bedingungen (Mutanten- versus Wildtyp-Stämme usw.) durchgeführt wurden verschiedene Wachstumsstadien…), die das Studium erleichtern.Eigenschaften
- Visualisierung der RNA-Seq-Strangabdeckung: Schwarz (Strang +), Lila (Strang -)
- ncRNA-Merkmalsanalyse
- X- und Y-Zooms werden unterstützt
- Erhöhte Sicherheit: HTTPS als Standard
Publikum
Wissenschaftsforschung
Benutzeroberfläche
Project ist ein User Interface (UI) System, Tk
Programmiersprache
Python, PHP
Datenbankumgebung
MySQL
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/cov2html/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
