Dies ist die Windows-App namens FastQC, deren neueste Version als v0.12.1sourcecode.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens FastQC mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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FastQC
BESCHREIBUNG
FastQC ist ein Analysetool zur Qualitätskontrolle, das entwickelt wurde, um potenzielle Probleme in Sequenzierungsdatensätzen mit hohem Durchsatz zu erkennen. Sein Ziel ist es, eine einfache Möglichkeit bereitzustellen, die Qualität von Rohsequenzdaten zu überprüfen, die aus Hochdurchsatz-Sequenzierungspipelines stammen. Dazu wird ein modularer Satz von Analysen an einer oder mehreren Rohsequenzdateien im fastq- oder bam-Format ausgeführt. Anschließend wird ein Bericht erstellt, der die Ergebnisse zusammenfasst und alle Bereiche hervorhebt, in denen die Bibliothek ungewöhnlich erscheint. Dies sollte Sie dann darauf hinweisen, wo Ihre Daten möglicherweise Probleme haben, und es Ihnen ermöglichen, die erforderlichen Schritte zur Korrektur zu unternehmen, bevor Sie weitere Analysen durchführen.
FastQC ist nicht an eine bestimmte Art von Sequenzierungstechnik gebunden, daher kann es verwendet werden, um Bibliotheken verschiedener Experimenttypen (Genomische Sequenzierung, ChIP-Seq, RNA-Seq, BS-Seq usw.) zu betrachten.
Eigenschaften
- Importiert Daten aus BAM-, SAM- oder FastQ-Dateien
- Bietet einen schnellen Überblick, der potenzielle Problembereiche hervorhebt
- Zusammenfassende Grafiken und Tabellen zur schnellen Bewertung von Daten
- Ergebnisse nach HTML exportieren
- Kann offline verwendet werden
Programmiersprache
Javac
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/fastqc.mirror/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, damit es auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt werden kann.
