Dies ist die Windows-App namens Kallisto, deren neueste Version als kallisto_windows-v0.50.0.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online beim kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens Kallisto mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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Kallisto
BESCHREIBUNG
Kallisto ist ein Programm zur nahezu optimalen Quantifizierung der Transkripthäufigkeit aus RNA-Seq-Daten oder allgemeiner von Zielsequenzen mithilfe von Hochdurchsatz-Sequenzierungs-Reads. Es basiert auf der Idee, Pseudoalignment zu verwenden, um die Kompatibilität von Lesevorgängen und Zielen schnell zu bestimmen, ohne dass eine Ausrichtung erforderlich ist.
Laut Benchmarks, die auf einem Mac-Desktop-Computer durchgeführt wurden, kann Kallisto 30 Millionen menschliche Bulk-RNA-Seq-Reads in weniger als 3 Minuten allein mit den Lesesequenzen und einem Transkriptomindex quantifizieren, dessen Erstellung allein mehr als 10 Minuten dauern kann. Und da es Pseudoalignment verwendet, ist es robust gegenüber Lesefehlern und bewahrt die für die Quantifizierung erforderlichen Schlüsselinformationen. Dadurch ist Kallisto nicht nur schnell, sondern auch hochpräzise. In vielen Benchmarks übertrifft es bestehende Tools sogar deutlich.
Eigenschaften
- Verwendet Pseudoalignment
- Schnell und genau
- Quantifizierte Bulk-RNA-Seq kann mit Sleuth analysiert werden
- Kann mit Bustools verwendet werden, um Einzelzell-RNA-Seq-Daten vorzuverarbeiten
Programmiersprache
C
Kategorien
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um es auf einfachste Weise online über eines unserer kostenlosen Betriebssysteme ausführen zu können.
