Dies ist die Windows-App namens NGSEP, deren neueste Version als NGSEPwindows_4.1.0.zip heruntergeladen werden kann. Es kann online im kostenlosen Hosting-Anbieter OnWorks für Workstations ausgeführt werden.
Laden Sie diese App namens NGSEP mit OnWorks kostenlos herunter und führen Sie sie online aus.
Befolgen Sie diese Anweisungen, um diese App auszuführen:
- 1. Diese Anwendung auf Ihren PC heruntergeladen.
- 2. Geben Sie in unserem Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX den gewünschten Benutzernamen ein.
- 3. Laden Sie diese Anwendung in einem solchen Dateimanager hoch.
- 4. Starten Sie einen beliebigen OS OnWorks-Online-Emulator von dieser Website, aber einen besseren Windows-Online-Emulator.
- 5. Rufen Sie vom gerade gestarteten OnWorks Windows-Betriebssystem unseren Dateimanager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX mit dem gewünschten Benutzernamen auf.
- 6. Laden Sie die Anwendung herunter und installieren Sie sie.
- 7. Laden Sie Wine aus den Software-Repositorys Ihrer Linux-Distributionen herunter. Nach der Installation können Sie dann auf die App doppelklicken, um sie mit Wine auszuführen. Sie können auch PlayOnLinux ausprobieren, eine schicke Schnittstelle über Wine, die Ihnen bei der Installation beliebter Windows-Programme und -Spiele hilft.
Wine ist eine Möglichkeit, Windows-Software unter Linux auszuführen, jedoch ohne Windows. Wine ist eine Open-Source-Windows-Kompatibilitätsschicht, die Windows-Programme direkt auf jedem Linux-Desktop ausführen kann. Im Wesentlichen versucht Wine, genügend Windows von Grund auf neu zu implementieren, damit alle diese Windows-Anwendungen ausgeführt werden können, ohne dass Windows tatsächlich benötigt wird.
SCREENSHOTS
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NGSEP
BESCHREIBUNG
NGSEP ist ein integriertes Framework für die Analyse von DNA-Sequenzierungsdaten mit hohem Durchsatz. Die Hauptanwendung von NGSEP ist die Konstruktion und nachgelagerte Analyse großer Datensätze genomischer Variation. NGSEP führt eine genaue Detektion und Genotypisierung von Single Nucleotid Variants (SNVs), kleinen und großen Indels, Short Tandem Repeats (STRs), Inversionen und Copy Number Variants (CNVs) durch. NGSEP bietet auch Module für funktionale Annotation, Filterung, Formatkonvertierung, Vergleich, Clustering, Imputation, Introgressionsanalyse und verschiedene Arten von Statistiken. Eine vollständige Liste der Funktionalitäten finden Sie in unserem Wiki (https://sourceforge.net/p/ngsep/wiki/Home/).
NEWS: Wir haben gerade die erste Version unseres de-novo Genome Assemblers zur Verfügung gestellt. Weitere Details finden Sie im Wiki.
Eigenschaften
- De-novo Genom-Assemblierung
- Alignment von Raw-Reads zu einem Referenzgenom
- Erkennung von SNPs, CNVs und Strukturvarianten
- VCF-Manipulation: funktionale Annotation, Zusammenführen, Filtern, Vergleichen, Formatkonvertierung, Imputation
- Liest Demultiplexing
- Ausrichtung von annotierten Genom-Assemblies
- Statistik und Filterung von Transkriptom-Anmerkungen im GFF3-Format
Publikum
Gesundheitswirtschaft, Wissenschaft/Forschung, Sonstiges Publikum, Landwirtschaft
Benutzeroberfläche
Java SWT, Konsole/Terminal, Eclipse
Programmiersprache
Javac
Dies ist eine Anwendung, die auch von https://sourceforge.net/projects/ngsep/ abgerufen werden kann. Es wurde in OnWorks gehostet, um auf einfachste Weise online von einem unserer kostenlosen Betriebssysteme ausgeführt zu werden.
