Este es el comando arden-analyse que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
arden-analyse: analiza los resultados del mapeo del genoma de referencia artificial
SINOPSIS
arden-analizar [opciones] [ENTRADA ARCHIVO] [CARPETA DE SALIDA]
DESCRIPCIÓN
Script para analizar los resultados del mapeo del genoma de referencia artificial. Este guion
identifica los TP / FP putativos en un conjunto de datos específico (lecturas).
CAMPUS
CARPETA DE SALIDA
ruta a la carpeta de destino de salida.
ENTRADA ARCHIVO
ppath al archivo ini. Para obtener el formato requerido, eche un vistazo a los archivos de ejemplo.
--versión
mostrar el número de versión del programa y salir
-h, --ayuda
mostrar este mensaje de ayuda y salir
-p PHRED, --fred=PHRED
Especifique la codificación PHRED de las lecturas de entrada, es decir, Illumina 1.3+ = -p 33. [predeterminado:
33]
-r RANGO, --rango interno=RANK
Utilice la clasificación interna para las lecturas (necesario si los nombres de lectura no se pueden
ser ordenado lexicográficamente de la misma manera en python y su sistema operativo por sam
herramientas). [predeterminado: 1]
Utilice arden-analyse en línea utilizando los servicios de onworks.net
