Este es el comando bp_chaos_plotp que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
bp_chaos_plot: un diagrama de caos a partir de secuencias de ADN y ARN
SINOPSIS
bp_chaos_plot.pl -i / - input = INPUTFILE -f / - formato = SEQFORMAT
-o / - salida = ARCHIVO DE SALIDA -g / - gráficos = FORMATO GRÁFICO
-w / - ancho = WIGHT -h / - alto = ALTO
DESCRIPCIÓN
Este script genera archivos de imagen usando la biblioteca de imágenes GD para visualizar nucleótidos
secuencias que utilizan la trama del caos.
CAMPUS
Los formatos de gráficos válidos son actualmente gd, gd2, png, wbmp, jpeg y gif.
El tamaño predeterminado del archivo de imagen es 600x400.
La entrada de secuencia se puede proporcionar mediante cualquiera de los tres métodos:
argumento sin nombre
bp_chaos_plot nombre de archivo
argumento con nombre
bp_chaos_plot -i nombre de archivo
entrada estándar
bp_chaos_plot <nombre de archivo
REALIMENTACIÓN
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Informes Errores
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https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
AUTOR - Jason Stajich
Correo electrónico [email protected]
HISTORIA
Este código se basa en el código EMBOSS C para chaos.c de Ian Longden. Se incluyen
documentación del código EMBOSS:
El caos produce una trama de caos. La aplicación original es parte del genoma ACEDB
paquete de base de datos, escrito por ** Richard Durbin (MRC LMB, Reino Unido) [email protected]y
Jean Thierry-Mieg (CRBM du CNRS, Francia) [email protected]
Use bp_chaos_plotp en línea usando los servicios de onworks.net
