Este es el comando bp_composite_LDp que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
bp_composite_LD -i filename.prettybase.txt --sortbyld> outfile
SINOPSIS
bp_composite_LD -i nombrearchivo.prettybase [-o out.LD] [-f prettybase / csv] [--sortbyld] [--noconvertindels]
DESCRIPCIÓN
Este es un script que permite una manera fácil de calcular LD compuesto.
OPCIONES
-yo --en nombre de archivo
-fo --format formato de genotipo (prettybase o CSV)
--sortbyld Para ver los datos ordenados por LD en lugar de solo todos los
Par de valores LD de sitio1 / sitio2.
-o o --out nombre de archivo de salida, de lo contrario se imprimirá en STDOUT
--noconvert (aplicable solo para archivos de formato prettybase)
si se especifica NO intentará convertir indel
estados a 'I' y eliminar estados ('-') a 'D'.
-ho --help ver esta documentación
AUTOR Jason Stajich, Mateo gallo
Para más información contacte con:
Matthew Hahn, Jason Stajich
Utilice bp_composite_LDp en línea utilizando los servicios de onworks.net
