Este es el comando bp_heterogeneity_testp que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
bp_heterogeneity_test: una prueba para distinguir entre selección y población
expansión.
SINOPSIS
prueba_heterogenetidad -mut_1 / - mutsyn synonymous_mut_count -mut_2 / - mutnon nonsyn_mut_count
-s / - tamaño pequeño tamaño_muestra [-i / - iteraciones iteraciones] [-o / - observado_D observado]
[-v / - detallado] [--silent] [-m / - método tajimaD o fuD] [--precision]
DESCRIPCIÓN
Esta es una implementación de la prueba de heterogenetidad como se describe en Hahn MW, Rausher MD,
y Cunningham CW. 2002. Genética 161(1): 11-20.
OPCIONES
Las opciones entre paréntesis de arriba son opcionales
-s o --samplesize tamaño de muestra
-mut_1 o --mutsyn sinónimo de recuento de mutaciones
-mut_2 o --mutnon recuento de mutaciones no sinónimo
-io - iteraciones número de iteraciones
-o o - observado observado D
-m o --método tajimaD o fuD para D o Fu de Tajima y D de Li
-v o --verbose imprime mensajes extra detallados
--silent Sea más silencioso
--precision Nivel de precisión - especificar el número de dígitos
(predeterminado 4)
AUTOR Mateo gallo
Para más información contacte con:
Matthew Hahn, Jason Stajich
Utilice bp_heterogeneity_testp en línea utilizando los servicios de onworks.net
